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    🧬 BIOLOGIE MOLECULAIRE

     Identification des anomalies génétiques:

    HLA B27 Génotypage
    Facteur II Prothrombine
    Facteur V de leiden
    Lactose Intolérance
    HLA B51 de Classe I
    HLA de Class I et II dans le cadre d’une greffe

    ♦ Identification des micro-organismes pathogènes:

    PANEL BACTERIALMycobacterium tuberculosis complex
    Streptococcus pneumoniae
    Streptococcus agalactiae
    Haemophilus influenzae
    Listeria monocytogenes    		Treponema pallidum
    Neisseria meningitidis
    Coxiella burnetii
    Borrelia burgdorferi
    Cryptococcus neoformans (fungus)
    PANEL VIRALHerpes Simplex Virus -1
    Herpes Simplex Virus -2
    Cytomegalovirus
    Epstein Barr Virus    		Varicella-Zoster
    Toscana Virus
    Enterovirus
    Parechovirus
    PANEL SEPSISStreptococcus pneumoniae  Stenotrophomonas maltophilia
    Candida spp.
    Acinetobacter baumannii
    Serratia marcescens/ Klebsiella pneumonia
    Streptococcus agalactiae
    Staphylococcus spp.
    Staphylococcus aureus
    Escherichia coli
    Enterobacter spp.
    Candida albicans
    Listeria monocytogenes
    Enterococcus spp.
    Pseudomonas aeruginosa
    Klebsiella pneumoniae
    Streptococcus spp.    		Neisseria meningitidis
    Proteus spp.
    Methicillin resistance gene
    Vancomycin resistance gene
    Vancomycin resistance gene
    Class A carbapenemase
    ß-lactamase SHV
    Extended-spectrum ß-lactamase CTX-M Class A carbapenemase
    Class B carbapenemase
    Class B carbapenemase IMP3, 15, 19_like
    Class D carbapenemase OXA23_like
    Class D carbapenemase OXA24_like
    Class D carbapenemase OXA48_like
    Class D carbapenemase OXA51_like
    Class D carbapenemase OXA58_like
    HPV PANEL36 different Type de HPV 
    Panel RespiratoireInfluenza virus A
    Influenza virus A H1N1
    Influenza virus AH3
    Influenza virus B
    Human metapneumovirus
    Respiratory syncytial virus A
    Respiratory syncytial virus B
    Enterovirus
    Rhinovirus
    Human parainfluenza virus type 1    		Human parainfluenza virus type 2
    Human parainfluenza virus type 3
    Human parainfluenza virus type 4
    Adenovirus
    Bocavirus
    Human Coronavirus 229E
    Human Coronavirus HKU-1
    Human Coronavirus NL63
    Human Coronavirus OC43
    SARS-COV-2
    Bordetella pertussis

    ♦ Génétique moléculaire des cancers:

    ONCOMINE BRCA1/2 PANELFULL GENE:
    BRCA1, BRCA2.
    ONCOMINE BRCA EXPANDED PANELFULL GENE:
    ATM, FANCD2, RAD54L, BARD1, MRE11, CHEK2, BRCA1, NBN, CDK12, BRCA2, PALB2, RAD51B, BRIP1, PPP2R2A, TP53.
    HOTSPOT PANELHOTSPOT:
    ABL1, EGFR, GNAS, KRAS, PTPN11, AKT1, ERBB2, GNAQ, MET, RB1, ALK, ERBB4, HNF1A, MLH1, RET, APC, EZH2, HRAS, MPL , SMAD4, ATM, FBXW7, IDH1, NOTCH1, SMARCB1, BRAF, FGFR1, JAK2, NPM1, SMO, CDH1, FGFR2, JAK3, NRAS, SRC, CDKN2A, FGFR3, IDH2, PDGFRA, STK11, CSF1R, FLT3, KDR, PIK3CA, TP53, CTNNB1, GNA11, KIT, PTEN, VHL.
    ONCOMINE FOCUS PANELHOTSPOT:
    AKT1, IDH2, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, FGFR2, FGFR3, GNA11, GNAQ, HRAS, IDH1, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KRAS, MAP2K1, MET, MTOR, MAP2K2, NRAS, SMO ,PDGFRA, RAF1, RET, PIK3CA, ROS1, ALK, AR, BRAF, CDK4.
    COPY NUMBER VARIATION:
    AKT1, ALK, AR, BRAF, CCND1, CDK4, CDK6, EGFR, ERBB2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, KIT, KRAS, MET, MYCN, PDGFRA, PIK3CA, MYC.
    GENE FUSIONS:
    BL1, AKT3, ALK, AXL, BRAF, EGFR, ERBB2, ERG, ETV1, ETV4, ETV5, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, NTRK1, NTRK2, NTRK3, RAF1, PDGFRA, RET, PPARG, ROS1.
    ION AMPLISEQ COLORECTAL AND LUNG CANCER PANELHOTSPOT: 2
    KRAS, NRAS, FGFR2, EGFR, STK11, FGFR1, BRAF, MAP2K1, ERBB4, PIK3CA, ALK, FBX7, AKT1, DDR2, NOTCH1, ERBB2, CTNNB1, SMAD4, PTEN, MET, FGFR3, TP53.
    ONCOMINE MYELOID PANELHOTSPOT:
    ABL1, BRAF, CBL, CSF3R, DNMT3A, FLT3, GATA2, HRAS, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, MPL ,MYD88, NPM1, NRAS, PTPN11, SETBP1, SF3B1, SRSF2, U2AF1, WT1.
    FULL GENE:
    ASXL1, BCOR, CALR, CEBPA, ETV6, EZH2, IKZF1, NF1, PHF6, PRPF8, RB1, RUNX1, SH2B3, STAG2, TET2, TP53, ZRSR2.
    GENE FUSIONS:
    ABL1, ALK, BCL2, BRAF, CCND1, CREBBP, EGFR, ETV6, FGFR1, FGFR2, FUS, HMGA2 ,JAK2, KMT2A, MECOM, MET, MLLT10, MLLT3, MYBL1, MYH11, NTRK3, NUP214, PDGFRA, PDGFRB, RARA, RBM15, RUNX1, TCF3, TFE3.
    EXPRESSION GENES:
    BAALC, MECOM, MYC, SMC1A, WT1.

    ♦ DPNI: Dépistage Prénatal Non Invasif

    Le DPNI est une technique de dépistage prénatal, qui permet de détecter précocement des anomalies des chromosomes chez le fœtus et en particulier des formes de la trisomie 21, trisomie 13 et 18. A partir d’une simple prise de sang chez la femme enceinte, le test DPNI permet d’analyser des fragments de l’ADN du fœtus, qui circule dans le sang maternel pendant la grossesse.

    Le DPNI est réalisable dès la 11 -ème  semaine d’aménorrhée ( = 09 -ème  semaine de grossesse) et tout au long de la grossesse. Rapide, fiable et sans danger, le DPNI permet une diminution significative des gestes invasif ( prélèvements de villosités choriales et de liquide amniotique ) réalisés chez les femmes à risque et ainsi, le nombre de pertes fœtales associées ( environ 1%).

    Les résultats du test DPNI sont disponibles dans les 7-10 jours ouvrables après la prise de sang.